Legend
Please note that a short description of a certain column can be displayed when you move your mouse cursor over the column's header and hold it still. Below, a more detailed description is shown per column.
Effect: The variant's effect on the protein's function, in the format 'R/C' where R is the value reported by the source and C is the value concluded by the curator; '+' indicating the variant affects function, '+?' probably affects function, '+*' affects function, not associated with individual's disease phenotype, '#' affects function, not associated with any known disease phenotype, '-' does not affect function, '-?' probably does not affect function, '?' effect unknown, '.' effect not classified.
Название по кДНК: Номенклатура HGVS по консенсусной последовательности RefSeq NM_000492.3: c.123C>T, c.123_145del, c.123_126dup.
Регион: Положение мутации в функуциональной области гена
All options:
- 5'НТО
- Экзон
- Интрон
- 3'НТО
- Промотер
- Энхансер
- Сайленсер
Название по белку: Номенклатура HGVS по консенсусной последовательности RefSeq NP_000483.3: p.Arg345Pro
Экзон/Интрон: Номер экзона/интрона, на который приходится вариант
Частота РФ (2014): Частота по данным Российского регистра больных МВ, в %
Частота РФ (2013): Частота по данным Российского регистра больных МВ, в %
Комментарии: Текст длиной до 400 символов
Название по РНК: Description of variant at RNA level (following HGVS recommendations).
- r.123c>u
- r.? = unknown
- r.(?) = RNA not analysed but probably transcribed copy of DNA variant
- r.spl? = RNA not analysed but variant probably affects splicing
- r.(spl?) = RNA not analysed but variant may affect splicing
- r.0? = change expected to abolish transcription
Фармакогеномика: Наличие специфических фармацевтических препаратов
All options:
- Ivacaftor (Kalydeco)
- Lumacaftor/Ivacaftor (Orkambi)
CFTR2: Ссылка на описание варианта в базе данных CFTR2
Частота РФ (2015): Частота по данным Российского регистра больных МВ, в %
Частота РФ (2016): Частота по данным Российского регистра больных МВ, в %
Контрольные материалы: Доступность биоматериалов и контрольных данных по варианту в биобанках
All options:
- Parseq Lab (www.parseq.ru); ДНК; MPS
- Parseq Lab (www.parseq.ru); ДНК; MPS; данные Сангера
- Parseq Lab (www.parseq.ru); ДНК; MPS; MLPA
Allele: On which allele is the variant located? Does not necessarily imply inheritance! 'Paternal' (confirmed or inferred), 'Maternal' (confirmed or inferred), 'Parent #1' or #2 for compound heterozygosity without having screened the parents, 'Unknown' for heterozygosity without having screened the parents, 'Both' for homozygozity.
Название: Тривиальное название, используемое клиницистами
Патогенность: Клиническая значимость, присвоенная куратором
All options:
- Патогенный
- Вероятно патогенный
- Неопределенного значения
- Вероятно доброкачественный
- Доброкачественный
Класс: Класс мутации в соответствии с классификацией мутаций по эффекуту, оказываемому на белок МВТР
All options:
Геномные координаты (hg19): Номенклатура HGVS по консенсусной последовательности RefSeq NC_000007.13
dbSNP: Ссылка на базу данных dbSNP
CFTR1: Ссылка на описание варианта в базе данных CFTR1
Тип: Классификация мутаций по изменениям на уровне ДНК
All options:
- SNP
- DEL
- INS
- DUP
- INDEL
- CNV
- SV
Ссылки: Ссылки на публикации, в которых упоминается вариант
|
Legend |
« First |
Prev |
|
1 |
2 |
3 |
|
Next |
Last » |
Effect
|
Название по кДНК
|
Регион
|
Название по белку
|
Экзон/Интрон
|
Частота РФ (2014)
|
Частота РФ (2013)
|
Комментарии
|
Название по РНК
|
Фармакогеномика
|
CFTR2
|
Частота РФ (2015)
|
Частота РФ (2016)
|
Контрольные материалы
|
Название
|
Патогенность
|
Класс
|
Геномные координаты (hg19)
|
dbSNP
|
CFTR1
|
Тип
|
Ссылки
|
Owner
|
./. |
c.-812T>G |
Промотер |
p.(=) |
0 |
0.00 |
0.00 |
До 2017 года вариант ошибочно считался вероятно-патогенным. |
r.(=) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
-741T>G |
Вероятно доброкачественный |
- |
g.117119337T>G |
{rs181008242} |
CFTR1:1 |
SNP |
Bienvenu at al 1993 |
- |
+/+ |
c.(273+1_274-1)_(1679+1_1680-1)del |
Экзон |
p.? |
4 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.? |
- |
link |
0.06 |
- |
- |
CFTRdele4-11 |
Патогенный |
- |
g.(117149197_117170952)_(117227888_117230406)del |
- |
- |
CNV |
- |
tsimakova_manager |
+/+ |
c.(273+1_274-1)_(1679+1_1680-1)del |
Экзон |
p.? |
4 |
- |
- |
- |
r.? |
- |
link |
0,06 |
- |
- |
CFTRdele4-11 |
Патогенный |
- |
g.(117149197_117170952)_(117227888_117230406)del |
- |
- |
DEL |
- |
- |
+/+ |
c.(53+1_54-1)_(164+1_165-1)del |
Экзон |
p.? |
2 |
0.03 |
- |
- |
r.? |
- |
link |
0,02 |
- |
- |
CFTRdele2 |
Патогенный |
- |
g.(117120202_117144306)_(117144418_117149087)del |
- |
- |
DEL |
- |
- |
+/+ |
c.(743+1_744-1)_(1584+1_1585-1)dup |
Экзон |
p.? |
7 |
0.11 |
0.12 |
- |
r.? |
- |
link |
0,10 |
- |
- |
CFTRdup6b-10 |
Патогенный |
- |
g.(117175466_117176601)_(117199710_117227792)dup |
- |
CFTR1:1480 |
DUP |
Hantash at al. 2007 |
- |
+/. |
c.[1210-34TG[11];1210−12[5]] |
Интрон |
p.(?) |
8 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
link |
- |
- |
- |
TG11-T5 |
Неопределенного значения |
- |
[g.117188661_117188662TG[11];g.117188683_117188683T[5]] |
- |
- |
SNP |
Castellani et al. 2008 |
Роман Васильев |
+/. |
c.[1210-34TG[13];1210−12[5]] |
Интрон |
p.? |
8 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.? |
- |
link |
- |
- |
- |
TG13-T5 |
Патогенный |
- |
[g.117188661_117188662TG[13];g.117188683_117188683T[5]] |
- |
- |
SNP |
Castellani et al. 2008 |
Роман Васильев |
+/. |
c.[350G>A;1210-12[5]] |
Экзон |
p.(Arg117His) |
4 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
link |
- |
- |
- |
R117H-5T |
Патогенный |
- |
[g.117171029G>A;g.117188683_117188683T[5]] |
rs78655421 |
- |
SNP |
Castellani et al. 2008 |
Роман Васильев |
+/. |
c.[350G>A;1210−12[7]] |
Экзон |
p.(Arg117His) |
4 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
link |
- |
- |
- |
R117H-7T |
Патогенный |
- |
[g.117171029G>A;g.117188683_117188683T[7]] |
- |
- |
SNP |
Castellani et al. 2008 |
Роман Васильев |
+/. |
[c.1327G>T;c.1727G>C;c.2002C>T] |
Экзон |
p.(?) |
10 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
link;link |
- |
- |
- |
R668C-G576A-D443Y |
Патогенный |
II |
[g.117188812G>T;g.117230454G>C;g.117232223C>T] |
rs147422190; rs1800098; rs1800100 |
CFTR1:218; CFTR1:590; CFTR1:764 |
SNP |
Castellani et al. 2008 |
Роман Васильев |
+/. |
[c.220C>T;c.3808G>A] |
Экзон |
p.(Arg74Trp) |
3 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
link;link |
- |
- |
- |
[R74W;D1270N] |
Патогенный |
II |
[g.117149143C>T;g.117282582G>A] |
rs115545701; rs11971167 |
CFTR1:49; CFTR1:537 |
SNP |
Castellani et al. 2008 |
Роман Васильев |
+/. |
c.1A>G |
Экзон |
p.? |
1 |
- |
- |
- |
r.? |
- |
link |
- |
- |
- |
M1V |
Патогенный |
I |
g.117120149A>G |
rs397508328 |
CFTR1:5 |
SNP |
Cheadle et al. 1994 |
Роман Васильев |
+/. |
c.43delC |
Экзон |
p.(Leu15Phefs*10) |
1 |
0.03 |
0.03 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,04 |
- |
- |
175delC |
Патогенный |
I |
g.117120191delC |
rs397508715 |
CFTR1:13 |
DEL |
Verlingue et al. 1995 |
Роман Васильев |
+/+ |
c.53+1G>T |
Интрон |
p.? |
0 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.? |
- |
link |
0.02 |
- |
- |
185+1G>T |
Патогенный |
I |
g.117120202G>T |
{rs397508746} |
CFTR1:893 |
SNP |
- |
- |
+/+ |
c.54-5944_273+10250del21084 |
Экзон |
p.(Ser18Argfs*16) |
2 |
5.93 |
5.94 |
- |
r.(?) |
- |
link |
5,68 |
5.71 |
- |
CFTRdele2,3(21kb) |
Патогенный |
I |
g.117138363_117159446del21084 |
- |
CFTR1:687 |
DEL |
Dörk et al. 2000 |
Роман Васильев |
+/+ |
c.55T>G |
Экзон |
p.(Trp19Gly) |
2 |
0.03 |
0.03 |
Вариант описан по данным Российского регистра МВ (2013, 2014) |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
W19G |
Патогенный |
- |
g.117144308T>G |
- |
- |
SNP |
- |
tsimakova_manager |
./. |
c.79G>T |
Экзон |
p.(Gly27*) |
2 |
- |
- |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
G27X |
Патогенный |
- |
g.117144332G>T |
{rs397508796} |
CFTR1:20 |
SNP |
- |
- |
+/. |
c.91C>T |
Экзон |
p.(Arg31Cys) |
2 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
link |
- |
- |
Parseq Lab (www.parseq.ru); ДНК; MPS |
R31C |
Неопределенного значения |
- |
g.117144344C>T |
rs1800073 |
CFTR1:860 |
SNP |
Gomez Lira et al. 2001 |
Роман Васильев |
+/. |
c.125C>T |
Экзон |
p.(Ser42Phe) |
2 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
- |
- |
- |
Parseq Lab (www.parseq.ru); ДНК; MPS |
S42F |
Патогенный |
II |
g.117144378C>T |
rs143456784 |
CFTR1:27 |
SNP |
Férec et al. 1995 |
Роман Васильев |
+/+ |
c.164+1G>T |
Интрон |
p.? |
2 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.? |
- |
link |
0.02 |
- |
- |
296+1G>T |
Патогенный |
I |
g.117144418G>T |
rs397508243 |
CFTR1:1130 |
SNP |
- |
- |
+/. |
c.165-1G>A |
Интрон |
p.? |
2 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.? |
- |
link |
- |
- |
- |
297-1G>A |
Патогенный |
I |
g.117149087G>A |
rs397508249 |
- |
SNP |
Orozco et al. 2000 |
Роман Васильев |
+/. |
c.169T>C |
Экзон |
p.(Trp57Arg) |
3 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
- |
- |
- |
Parseq Lab (www.parseq.ru); ДНК; MPS |
W57R |
Патогенный |
- |
g.117149092T>C |
rs397508272 |
CFTR1:731 |
SNP |
http://www.genet.sickkids.on.ca/resource/nl/CFnewslet.69.html |
Роман Васильев |
+/. |
c.170G>A |
Экзон |
p.(Trp57*) |
3 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
link |
- |
- |
- |
W57X(TGG>TAG) |
Патогенный |
I |
g.117149093G>A |
rs397508279 |
CFTR1:41 |
SNP |
Audrézet et al. 1993 |
Роман Васильев |
+/. |
c.171G>A |
Экзон |
p.(Trp57*) |
3 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
link |
- |
- |
- |
W57X(TGG>TGA) |
Патогенный |
I |
g.117149094G>A |
rs121909025 |
CFTR1:1143 |
SNP |
Le Maréchal et al. 2001 |
Роман Васильев |
+/. |
c.223C>T |
Экзон |
p.(Arg75*) |
3 |
0.03 |
0.03 |
- |
r.(?) |
- |
link |
0,04 |
- |
- |
R75X |
Патогенный |
I |
g.117149146C>T |
rs121908749 |
CFTR1:50 |
SNP |
- |
Роман Васильев |
+/. |
c.233dupT |
Экзон |
p.(Trp79Leufs*32) |
3 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
link |
- |
- |
- |
365-366insT(359insT) |
Патогенный |
I |
g.117149156dupT |
rs397508366 |
CFTR1:1439; CFTR1:52 |
DUP |
http://www.genet.sickkids.on.ca/resource/nl/CFnewslet.63.html |
Роман Васильев |
+/+ |
c.236G>A |
Экзон |
p.(Trp79*) |
3 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
W79X |
Патогенный |
- |
g.117149159G>A |
rs[1] |
CFTR1:54 |
SNP |
Bonizzato at al 1995 |
- |
+/+ |
c.252T>A |
Экзон |
p.(Tyr84*) |
3 |
0.05 |
0.06 |
Вариант описан по данным Российского регистра МВ (2013, 2014) |
r.(?) |
- |
- |
0,06 |
- |
- |
Y84X |
Патогенный |
- |
g.117149175T>A |
- |
- |
SNP |
- |
tsimakova_manager |
+/. |
c.254G>A |
Экзон |
p.(Gly85Glu) |
3 |
0.13 |
0.12 |
- |
r.(?) |
- |
link |
0,10 |
- |
- |
G85E |
Патогенный |
- |
g.117149177G>A |
rs75961395 |
CFTR1:55 |
SNP |
Castellani et. al., 2008 |
Роман Васильев |
+/+ |
c.262_263delTT |
Экзон |
p.(Leu88Ilefs*22) |
3 |
0.85 |
0.89 |
- |
r.(?) |
- |
link |
0,82 |
0.89 |
- |
394delTT |
Патогенный |
I |
g.117149185_117149186delTT |
rs121908769 |
CFTR1:57 |
DEL |
Schwarz et al. 1994 |
Роман Васильев |
+/+ |
c.274-6T>C |
Интрон |
p.(=) |
3 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(=) |
- |
- |
- |
- |
- |
406-6T>C |
Патогенный |
V |
g.117170947T>C |
rs371315549 |
CFTR1:67 |
SNP |
Claustres et al. 1993 |
Роман Васильев |
+/. |
c.274-1G>A |
Интрон |
p.? |
3 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.? |
- |
link |
0,02 |
- |
- |
406-1G>A |
Патогенный |
I |
g.117170952G>A |
rs121908792 |
CFTR1:885 |
SNP |
Wong et al. 2001 |
Роман Васильев |
+/+ |
c.274G>A |
Экзон |
p.(Glu92Lys) |
4 |
2.62 |
2.58 |
- |
r.(?) |
- |
link |
2,43 |
2.67 |
- |
E92K |
Патогенный |
- |
g.117170953G>A |
rs121908751 |
CFTR1:71 |
SNP |
Nunes et al. 1993 |
Роман Васильев |
+/+ |
c.275A>C |
Экзон |
p.(Glu92Ala) |
4 |
- |
- |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
E92A |
Патогенный |
- |
g.117170954A>C |
- |
- |
SNP |
- |
- |
+/. |
c.287C>A |
Экзон |
p.(Ala96Glu) |
4 |
0.05 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,04 |
- |
- |
A96E |
Патогенный |
- |
g.117170966C>A |
rs397508449 |
CFTR1:1134 |
SNP |
http://www.genet.sickkids.on.ca/MutationDetailPage.external?sp=1134 |
Роман Васильев |
+/. |
c.293A>G |
Экзон |
p.(Gln98Arg) |
4 |
0.05 |
0.03 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,08 |
- |
- |
Q98R |
Патогенный |
- |
g.117170972A>G |
rs397508464 |
CFTR1:74 |
SNP |
Romey et al. 1995 |
Роман Васильев |
+/+ |
c.324delC |
Экзон |
p.(Tyr109Metfs*15) |
4 |
0.03 |
0.03 |
Вариант описан по данным Российского регистра МВ (2013, 2014) |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
456delC |
Патогенный |
- |
g.117171003delC |
- |
- |
DEL |
- |
tsimakova_manager |
+/. |
c.325_327delinsG |
Экзон |
p.(Tyr109Glyfs*4) |
4 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
link |
- |
- |
- |
457TAT>G |
Патогенный |
I |
g.117171004_117171006delTATinsG |
rs121908798 |
CFTR1:81 |
INDEL |
Ravnik-Glavac et al. 1993 |
Роман Васильев |
+/. |
c.328G>C |
Экзон |
p.(Asp110His) |
4 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
link |
0,04 |
- |
- |
D110H |
Патогенный |
- |
g.117171007G>C |
rs113993958 |
CFTR1:84 |
SNP |
Dean et al. 1990 |
Роман Васильев |
+/. |
c.349C>T |
Экзон |
p.(Arg117Cys) |
4 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
link |
0,02 |
- |
- |
R117C |
Патогенный |
- |
g.117171028C>T |
rs77834169 |
CFTR1:88 |
SNP |
Dörk et al. 1994 |
Роман Васильев |
?/? |
c.350G>A |
Экзон |
p.(Arg117His) |
4 |
0.08 |
0.09 |
Патогенность варианта зависит от длины поли-Т тракта в интроне 8 CFTR (5T, 7T, 9T). |
r.(?) |
Ivacaftor (Kalydeco) |
link |
0,06 |
- |
- |
R117H |
Неопределенного значения |
- |
g.117171029G>A |
rs78655421 |
CFTR1:89 |
SNP |
de Nooijer et al. 2011 |
tsimakova_manager |
+/+ |
c.358G>A |
Экзон |
p.(Ala120Thr) |
4 |
0.03 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
A120T |
Патогенный |
- |
g.117171037G>A |
rs201958172 |
CFTR1:92 |
SNP |
Chillón et al. 1994 |
tsimakova_manager |
+/+ |
c.409_412delCTCC |
Экзон |
p.(Leu137Tyrfs*15) |
4 |
- |
- |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
541del4 |
Патогенный |
- |
g.117171088_117171091delCTCC |
- |
CFTR1:97 |
DEL |
- |
- |
+/+ |
c.415_416insTAC |
Экзон |
p.(Leu138dup) |
4 |
0.95 |
1.00 |
В базе данных CFTR1 вариант проаннотирован дважды (L138ins и 546insCTA), в обоих случаях с ошибками. |
r.(?) |
- |
- |
1,07 |
1.15 |
- |
L138ins |
Патогенный |
- |
g.117171094_117171095insTAC |
rs752803445 |
CFTR1:1118 |
DUP |
Dork et al.(1997), Chernykh et al. (2010) |
tsimakova_manager |
+/+ |
c.422C>A |
Экзон |
p.(Ala141Asp) |
4 |
0.03 |
0.03 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
A141D |
Патогенный |
- |
g.117171101C>A |
rs397508700 |
CFTR1:101 |
SNP |
Gouya et al. 1997 |
tsimakova_manager |
+/. |
c.442delA |
Экзон |
p.(Ile148Leufs*5) |
4 |
0.03 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
link |
0,04 |
- |
- |
574delA |
Патогенный |
I |
g.117171121delA |
rs121908770 |
CFTR1:104 |
DEL |
Fanen et al. 1992 |
Роман Васильев |
-/. |
c.443T>C |
Экзон |
p.(Ile148Thr) |
4 |
0.00 |
0.03 |
- |
r.(?) |
- |
link |
0,02 |
- |
- |
I148T |
Доброкачественный |
- |
g.117171122T>C |
rs35516286 |
CFTR1:105 |
SNP |
Rohlfs et al. 2002 |
Роман Васильев |
+/. |
c.472dupA |
Экзон |
p.(Ser158Lysfs*5) |
4 |
0.08 |
0.06 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,06 |
- |
- |
604insA |
Патогенный |
I |
g.117171151dupA |
- |
- |
DEL |
Stepanova et al. 2016 |
Роман Васильев |
+/. |
c.489+1G>T |
Интрон |
p.? |
4 |
0.19 |
0.17 |
- |
r.? |
- |
link |
0,16 |
0.15 |
- |
621+1G>T |
Патогенный |
I |
g.117171169G>T |
rs78756941 |
CFTR1:112 |
SNP |
Castellani C et. al., 2008 |
Роман Васильев |
+/+ |
c.494delT |
Экзон |
p.(Leu165*) |
5 |
0.05 |
0.06 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,04 |
- |
- |
624delT |
Патогенный |
- |
g.117174334delT |
rs397508737 |
CFTR1:117 |
DEL |
Schrijver et al. 2005 |
tsimakova_manager |
+/+ |
c.531delT |
Экзон |
p.(Ile177Metfs*12) |
5 |
- |
- |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
663delT |
Патогенный |
- |
g.117174371delT |
- |
CFTR1:888 |
DEL |
Wong at al.2001 |
- |
+/+ |
c.550delC |
Экзон |
p.(Leu184Phefs*5) |
5 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,04 |
- |
- |
681delC |
Патогенный |
- |
g.117174390delC |
rs397508752 |
CFTR1:124 |
DEL |
Zielenski at al.1995 |
- |
+/. |
c.579+3A>G |
Интрон |
p.? |
5 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.? |
- |
- |
- |
- |
- |
711+3A>G |
Патогенный |
V |
g.117174422A>G |
rs397508761 |
CFTR1:132 |
SNP |
Petreska et al. 1994 |
Роман Васильев |
+/. |
c.580-1G>T |
Интрон |
p.? |
5 |
0.19 |
0.17 |
- |
r.? |
- |
link |
0,16 |
0.15 |
- |
712-1G>T |
Патогенный |
I |
g.117175301G>T |
rs121908793 |
CFTR1:135 |
SNP |
http://www.genet.sickkids.on.ca/resource/nl/CFnewslet.59.html |
Роман Васильев |
+/+ |
c.583delC |
Экзон |
p.(Ala196Hisfs*19) |
6 |
0.03 |
0.00 |
Вариант описан по данным Российского регистра МВ (2013, 2014) |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
718delC |
Патогенный |
- |
g.117175305delC |
- |
- |
DEL |
- |
tsimakova_manager |
+/. |
c.613C>T |
Экзон |
p.(Pro205Ser) |
6 |
0.03 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
link |
0,02 |
- |
- |
P205S |
Патогенный |
- |
g.117175335C>T |
rs121908803 |
CFTR1:138 |
SNP |
Chillón et al. 1993 |
Роман Васильев |
+/. |
c.650A>G |
Экзон |
p.(Glu217Gly) |
6 |
0.05 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,08 |
- |
- |
E217G |
Неопределенного значения |
- |
g.117175372A>G |
rs121909046 |
CFTR1:844 |
SNP |
http://www.genet.sickkids.on.ca/resource/nl/CFnewslet.70.html |
Роман Васильев |
+/. |
c.868C>T |
Экзон |
p.(Gln290*) |
7 |
0.03 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
Q290X |
Патогенный |
I |
g.117176726C>T |
rs397508808 |
CFTR1:160 |
SNP |
http://www.genet.sickkids.on.ca/resource/nl/CFnewslet.65.html |
Роман Васильев |
+/+ |
c.869+2T>G |
Интрон |
p.? |
7 |
- |
- |
- |
r.? |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
c.869+2T>G |
Патогенный |
- |
g.117176729T>G |
- |
- |
SNP |
- |
- |
+/+ |
c.895delG |
Экзон |
p.(Ala299Glnfs*4) |
8 |
0.03 |
0.03 |
Вариант описан по данным Российского регистра МВ (2013, 2014) |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
1027delG |
Патогенный |
- |
g.117180179delG |
- |
- |
DEL |
- |
tsimakova_manager |
+/+ |
c.985A>T |
Экзон |
p.(Lys329*) |
8 |
0.00 |
0.03 |
Вариант описан по данным Российского регистра МВ (2013) |
r.(?) |
- |
- |
- |
- |
- |
K329X |
Патогенный |
- |
g.117180269A>T |
- |
- |
SNP |
- |
tsimakova_manager |
+/+ |
c.1000C>T |
Экзон |
p.(Arg334Trp) |
8 |
0.85 |
0.86 |
- |
r.(?) |
- |
link |
0,80 |
0.80 |
- |
R334W |
Патогенный |
IV |
g.117180284C>T |
rs121909011 |
CFTR1:180 |
SNP |
Antinolo et al. 1997 |
Тамара Симакова |
+/. |
c.1001G>T |
Экзон |
p.(Arg334Leu) |
8 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
- |
- |
- |
Parseq Lab (www.parseq.ru); ДНК; MPS |
R334L |
Патогенный |
- |
g.117180285G>T |
rs397508137 |
CFTR1:632 |
SNP |
Dörk et al. 1997 |
Роман Васильев |
+/. |
c.1040G>C |
Экзон |
p.(Arg347Pro) |
8 |
0.13 |
0.14 |
- |
r.(?) |
- |
link |
0,10 |
0.11 |
- |
R347P |
Патогенный |
IV |
g.117180324G>C |
rs77932196 |
CFTR1:193 |
SNP |
Dean et al., 1990 |
Роман Васильев |
-/. |
c.1043T>A |
Экзон |
p.(Met348Lys) |
8 |
- |
- |
- |
r.(?) |
- |
- |
- |
- |
- |
M348K |
Доброкачественный |
- |
g.117180327T>A |
rs142920240 |
CFTR1:194 |
SNP |
Audrézet et al. 1993 |
Роман Васильев |
+/. |
c.1046C>T |
Экзон |
p.(Ala349Val) |
8 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
- |
- |
- |
Parseq Lab (www.parseq.ru); ДНК; MPS |
A349V |
Патогенный |
II |
g.117180330C>T |
rs121909021 |
CFTR1:195 |
SNP |
Audrézet et al. 1993 |
Роман Васильев |
+/. |
c.1052C>G |
Экзон |
p.(Thr351Ser) |
8 |
0.00 |
0.00 |
До 2017 года вариант ошибочно считался патогенным. |
r.(?) |
- |
- |
- |
- |
- |
T351S |
Вероятно доброкачественный |
- |
g.117180336C>G |
rs1800086 |
CFTR1:864 |
SNP |
Mercier et al. 1993 |
Роман Васильев |
+/+ |
c.1075C>A |
Экзон |
p.(Gln359Lys) |
8 |
0.03 |
0.03 |
Вариант встречается исключительно в составе комплексной аллели [Q359K;T360K] |
r.(?) |
- |
link |
0,02 |
- |
- |
Q359K |
Патогенный |
- |
g.117180359C>A |
rs76879328 |
CFTR1:197 |
SNP |
Shoshani et al. 1993 |
tsimakova_manager |
+/+ |
c.1079C>A |
Экзон |
p.(Thr360Lys) |
8 |
0.03 |
0.03 |
Вариант встречается исключительно в составе комплексной аллели [Q359K;T360K] |
r.(?) |
- |
link |
0,02 |
- |
- |
T360K |
Патогенный |
- |
g.117180363C>A |
rs75053309 |
CFTR1:197 |
SNP |
Shoshani et al. 1993 |
tsimakova_manager |
+/+ |
c.1083G>A |
Экзон |
p.(Trp361*) |
8 |
- |
- |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
p.W361X |
Патогенный |
- |
g.117180367G>A |
- |
- |
SNP |
- |
- |
+/. |
c.1116+1G>A |
Интрон |
p.? |
8 |
0.03 |
0.03 |
- |
r.? |
- |
- |
0,06 |
- |
- |
1248+1G>A |
Патогенный |
I |
g.117180401G>A |
rs397508158 |
CFTR1:204 |
SNP |
- |
Роман Васильев |
+/. |
c.1117-1G>A |
Интрон |
p.? |
8 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.? |
- |
link |
- |
- |
- |
1249-1G>A |
Патогенный |
I |
g.117182069G>A |
rs797045160 |
- |
SNP |
- |
Роман Васильев |
+/+ |
c.1163C>T |
Экзон |
p.(Thr388Met) |
9 |
- |
- |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
T388M |
Патогенный |
- |
g.117182116C>T |
{rs143860237} |
CFTR1:658 |
SNP |
- |
- |
+/. |
c.1202G>A |
Экзон |
p.(Trp401*) |
9 |
0.03 |
0.03 |
- |
r.(?) |
- |
link |
- |
- |
- |
W401X(TGG>TAG) |
Патогенный |
I |
g.117182155G>A |
rs397508174 |
CFTR1:718 |
SNP |
Cuppens et al. 1993 |
Роман Васильев |
+/. |
c.1203G>A |
Экзон |
p.(Trp401*) |
9 |
0.03 |
0.03 |
- |
r.(?) |
- |
link |
- |
- |
- |
W401X(TGG>TGA) |
Патогенный |
I |
g.117182156G>A |
rs397508175 |
CFTR1:211 |
SNP |
Cuppens et al. 1993 |
Роман Васильев |
+/+ |
c.1209G>C |
Экзон |
p.(Glu403Asp) |
9 |
0.03 |
0.03 |
Вариант описан по данным Российского регистра МВ (2013, 2014) |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
E403D |
Патогенный |
- |
g.117182162G>C |
rs397508177 |
CFTR1:1148 |
SNP |
Sullivan et al. 1995 |
Залина Тахирова |
+/. |
c.1209+1G>A |
Интрон |
p.? |
9 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.? |
- |
link |
- |
- |
- |
1341+1G>A |
Патогенный |
I |
g.117182163G>A |
rs397508176 |
CFTR1:618 |
SNP |
- |
Роман Васильев |
./. |
c.1210-13G>T |
Интрон |
p.(=) |
0 |
- |
- |
- |
r.(=) |
- |
- |
- |
- |
- |
10TG-9T |
Доброкачественный |
- |
g.117188682G>T |
rs10229820 |
- |
SNP |
Sun et al. 2006 |
Тамара Симакова |
+/+ |
c.1210-11T>G |
Интрон |
p.(=) |
8 |
0.00 |
0.03 |
- |
r.(=) |
- |
link |
- |
- |
- |
TG12-T5 |
Патогенный |
- |
g.117188684T>G |
rs73715573 |
CFTR1:1361 |
SNP |
Castellani et al. 2008 |
Роман Васильев |
+/+ |
c.1219delG |
Экзон |
p.(Glu407Asnfs*35) |
10 |
- |
- |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
1219delG |
Патогенный |
- |
g.117188704delG |
- |
- |
DEL |
- |
- |
+/+ |
c.1234delG |
Экзон |
p.(Ala412Glnfs*30) |
10 |
0.03 |
0.03 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
1366delG |
Патогенный |
- |
g.117188719delG |
rs397508181 |
CFTR1:752 |
DEL |
Loukas et al. 2015 |
tsimakova_manager |
+/. |
c.1240_1244delCAAAA |
Экзон |
p.(Asn415*) |
10 |
0.11 |
0.09 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,22 |
- |
- |
1367del5 |
Патогенный |
I |
g.117188725_117188729delCAAAA |
rs397508184 |
CFTR1:985 |
DEL |
Schaller et al. 2007 |
Роман Васильев |
+/+ |
c.1382G>A |
Экзон |
p.(Gly461Glu) |
10 |
0.03 |
0.03 |
Вариант описан по данным Российского регистра МВ (2013, 2014) |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
G461E |
Патогенный |
- |
g.117188867G>A |
- |
- |
SNP |
- |
Залина Тахирова |
+/. |
c.1393-2A>G |
Интрон |
p.? |
10 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.? |
- |
link |
- |
- |
- |
1525-2A>G |
Патогенный |
V |
g.117199516A>G |
rs397508201 |
CFTR1:1304 |
SNP |
Ferec et al. 2006 |
Роман Васильев |
+/. |
c.1393-1G>A |
Интрон |
p.? |
10 |
0.03 |
0.03 |
- |
r.? |
- |
link |
0,03 |
- |
- |
1525-1G>A |
Патогенный |
I |
g.117199517G>A |
rs397508200 |
CFTR1:227 |
SNP |
Dörk et al. 1993 |
Роман Васильев |
+/. |
c.1397C>A |
Экзон |
p.(Ser466*) |
11 |
0.37 |
0.17 |
- |
r.(?) |
- |
link |
0,27 |
- |
- |
S466X(TCA>TAA) |
Патогенный |
I |
g.117199522C>A |
rs121908805 |
CFTR1:230 |
SNP |
Mittre et al. 1996 |
Роман Васильев |
+/. |
c.1397C>G |
Экзон |
p.(Ser466*) |
11 |
0.37 |
0.31 |
Вариант встречается самостоятельно или в составе комплексной аллели [S466X;R1070Q] |
r.(?) |
- |
link |
0,27 |
- |
- |
S466X(TCA>TGA) |
Патогенный |
I |
g.117199522C>G |
rs121908805 |
CFTR1:229 |
SNP |
Deufel et al. 1994 |
Роман Васильев |
+/. |
c.1399C>T |
Экзон |
p.(Leu467Phe) |
11 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
- |
- |
- |
- |
L467F |
Вероятно патогенный |
- |
g.117199524C>T |
rs1800089 |
CFTR1:751 |
SNP |
Elahi et al. 2006 |
Роман Васильев |
+/. |
c.1438G>A |
Экзон |
p.(Gly480Ser) |
11 |
0.03 |
0.03 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
G480S |
Патогенный |
- |
g.117199563G>A |
rs79282516 |
CFTR1:1210 |
SNP |
http://www.genet.sickkids.on.ca/MutationDetailPage.external?sp=1210 |
Роман Васильев |
+/+ |
c.1439G>A |
Экзон |
p.(Gly480Asp) |
11 |
0.00 |
0.03 |
- |
r.(?) |
- |
- |
- |
- |
- |
G480D |
Патогенный |
- |
g.117199564G>A |
rs397508208 |
CFTR1:232 |
SNP |
Baker et al. 2016 |
tsimakova_manager |
+/+ |
c.1478A>G |
Экзон |
p.(Gln493Arg) |
11 |
0.05 |
0.06 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,04 |
- |
- |
Q493R |
Патогенный |
- |
g.117199603A>G |
rs397508214 |
CFTR1:239 |
SNP |
Angelicheva et al. 1997 |
tsimakova_manager |
+/. |
c.1487G>A |
Экзон |
p.(Trp496*) |
11 |
0.03 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
W496X |
Патогенный |
I |
g.117199612G>A |
rs397508216 |
CFTR1:241 |
SNP |
Balassopoulou et al. 1994 |
Роман Васильев |
+/. |
c.1517T>C |
Экзон |
p.(Ile506Thr) |
11 |
0.05 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,06 |
- |
- |
I506T |
Патогенный |
- |
g.117199642T>C |
rs397508224 |
CFTR1:244 |
SNP |
- |
Роман Васильев |
+/. |
c.1519_1521delATC |
Экзон |
p.(Ile507del) |
11 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
link |
- |
- |
- |
[delta]I507 |
Патогенный |
II |
g.117199644_117199646delATC |
rs121908745 |
CFTR1:245 |
DEL |
Kerem et al. 1990 |
Роман Васильев |
+/+ |
c.1521_1523delCTT |
Экзон |
p.(Phe508del) |
11 |
51.53 |
52.21 |
- |
r.(?) |
- |
link |
51,67 |
52.06 |
- |
F508del |
Патогенный |
II |
g.117199646_117199648delCTT |
rs199826652; rs113993960 |
CFTR1:246 |
DEL |
Bobadilla et al. 2002 |
Тамара Симакова |
-/. |
c.1523T>G |
Экзон |
p.(Phe508Cys) |
11 |
- |
- |
- |
r.(?) |
- |
- |
- |
- |
- |
F508C |
Доброкачественный |
- |
g.117199648T>G |
rs74571530 |
CFTR1:1024 |
SNP |
Kobayashi et al. 1990 |
Роман Васильев |
+/. |
c.1528delG |
Экзон |
p.(Val510Phefs*17) |
11 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
1660delG |
Патогенный |
I |
g.117199653delG |
- |
CFTR1:1610 |
DEL |
- |
Роман Васильев |
+/+ |
c.1545_1546delTA |
Экзон |
p.(Tyr515*) |
11 |
0.98 |
0.77 |
- |
r.(?) |
- |
link |
1,29 |
1.44 |
- |
1677delTA |
Патогенный |
- |
g.117199670_117199671delTA |
rs121908776 |
CFTR1:247 |
DEL |
Angelicheva et al. 1994 |
Тамара Симакова |
+/+ |
c.1580dupA |
Экзон |
p.(Glu528Argfs*40) |
11 |
- |
- |
- |
r.(?) |
- |
- |
0,02 |
- |
- |
E527fs |
Патогенный |
- |
g.117199705dupA |
- |
- |
DUP |
- |
- |
-/. |
c.1584G>A |
Экзон |
p.(=) |
11 |
0.00 |
0.00 |
- |
r.(=) |
- |
- |
- |
- |
- |
1716G>A (E528E) |
Доброкачественный |
- |
g.117199709G>A |
rs1800095 |
CFTR1:1026 |
SNP |
Castellani et al. 2008 |
Роман Васильев |
|
Legend |
« First |
Prev |
|
1 |
2 |
3 |
|
Next |
Last » |