Legend
Please note that a short description of a certain column can be displayed when you move your mouse cursor over the column's header and hold it still. Below, a more detailed description is shown per column.
Affects function: The variant's effect on the protein's function, in the format 'R/C' where R is the value reported by the source and C is the value concluded by the curator; '+' indicating the variant affects function, '+?' probably affects function, '+*' affects function, not associated with individual's disease phenotype, '#' affects function, not associated with any known disease phenotype, '-' does not affect function, '-?' probably does not affect function, '?' effect unknown, '.' effect not classified.
Название по кДНК: Номенклатура HGVS по консенсусной последовательности RefSeq NM_000492.3: c.123C>T, c.123_145del, c.123_126dup.
Регион: Положение мутации в функуциональной области гена
All options:
- 5'НТО
- Экзон
- Интрон
- 3'НТО
- Промотер
- Энхансер
- Сайленсер
Название по белку: Description of variant at protein level (following HGVS recommendations).
- p.(Arg345Pro) = change predicted from DNA (RNA not analysed)
- p.Arg345Pro = change derived from RNA analysis
- p.? = unknown effect
- p.0? = probably no protein produced
Экзон/Интрон: Номер экзона, на который приходится вариант
Частота РФ (2014): Частота по данным Российского регистра больных МВ, в %
Частота РФ (2013): Частота по данным Российского регистра больных МВ, в %
Комментарии: Текст длиной до 400 символов
Название по РНК: Description of variant at RNA level (following HGVS recommendations).
- r.123c>u
- r.? = unknown
- r.(?) = RNA not analysed but probably transcribed copy of DNA variant
- r.spl? = RNA not analysed but variant probably affects splicing
- r.(spl?) = RNA not analysed but variant may affect splicing
- r.0? = change expected to abolish transcription
Фармакогеномика: Наличие специфических фармацевтических препаратов
All options:
- Ivacaftor (Kalydeco)
- Lumacaftor/Ivacaftor (Orkambi)
CFTR2: Ссылка на описание варианта в базе данных CFTR2v2
Частота РФ (2015): Частота по данным Российского регистра больных МВ, в %
Частота РФ (2016): Частота по данным Российского регистра больных МВ, в %
Контрольные материалы: Доступность биоматериалов и контрольных данных по варианту в биобанках
All options:
- Parseq Lab (www.parseq.ru); ДНК; MPS
- Parseq Lab (www.parseq.ru); ДНК; MPS; данные Сангера
- Parseq Lab (www.parseq.ru); ДНК; MPS; MLPA